先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム

情報解析講習会ビデオ<2017年度 情報解析講習会(UNIX初心者向け)>

「先進ゲノム支援」では、平成29年度の情報解析講習会として、主にUnix初心者を対象とした講習会を3/22-23に国立遺伝学研究所DDBJセンターにて開催致しました。
講習会の動画は以下からご覧頂くことが可能です。なお、講習会参加者には事前にDDBJスーパーコンピューターのアカウント取得と、TeraTerm他必要なソフトのインストールおよびスパコンへの接続設定を行って頂きました。

 

■講習会プログラム(講習会の資料はそれぞれダウンロードしていただくことができます。)
【3月22日:1日目】

13:00~13:10
講習会説明(黒川顕:国立遺伝学研究所)
13:10~13:40
DDBJスパコン概要説明(中村保一:国立遺伝学研究所) 資料

13:40~15:10
DDBJへの接続方法、UNIX基本コマンド(谷澤靖洋:国立遺伝学研究所) 資料

15:10~15:20
休 憩
15:20~16:50
シェルスクリプト&バッチジョブ(森宙史:国立遺伝学研究所) 資料

16:50~17:00
休 憩
17:00~18:00
DDBJスパコンでの解析の実践I(DDBJパイプライン)
(望月孝子:国立遺伝学研究所) 資料

【3月23日:2日目】

10:00~12:00
DDBJスパコンでの解析の実践II(RNA-seq解析等)
(高橋弘喜:千葉大学) 資料1 資料2

13:00~15:00
DDBJスパコンでの解析の実践III(バクテリアゲノム解析:
アセンブルからアノテーションまで)(谷澤靖洋:国立遺伝学研究所) 資料