先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム

情報解析講習会ビデオ<2018年度 情報解析講習会(中級者向け)>

 

【11月19日:1日目】

13:00~13:10
講習会説明(黒川顕:国立遺伝学研究所)
13:10~14:30
1-1 RNA-seqの各種ツールによる解析 (遺伝研・望月孝子)

14:40~16:10
1-2 Pythonの基本文法 (理研・新海典夫)

16:20~17:50
1-3 文字列処理、ファイルの読み書き、正規表現 (千葉大・高橋弘喜)

【11月20日:2日目】

10:00~11:30
2-1 Jupyter notebook、Biopython -Jupyter notebookの使い方-(遺伝研・谷澤靖洋)

10:00~11:30
2-1 Jupyter notebook、Biopython -Biopythonについて-(遺伝研・谷澤靖洋)

11:40~13:00
2-2 表形式ファイルの処理(Pandas)、RNA-seqデータの補正 (遺伝研・谷澤靖洋)

13:00~13:50
昼食休憩
13:50~15:20
2-3 視覚化 (matplotlib, seaborn) (農研機構・孫建強)

15:30~17:00
2-4 統計的仮説検定 (遺伝研・森宙史)

【11月21日:3日目】

10:00~11:30
3-1 多変量解析(PCA, MDS, クラスタリング等) (遺伝研・東光一)

11:30~13:00
人工知能・機械学習入門 (別レポジトリ) と スライド (Dropbox)(産総研/株式会社ヒューマノーム研究所・瀬々潤)