先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム

[班員による成果公開]がんに存在する異常なメッセンジャーRNAの全長構造を同定

東京大学大学院新領域創成科学研究科の関 真秀特任助教と鈴木 穣教授らのグループは、国立がん研究センター先端医療開発センター免疫療法開発分野・中面哲也分野長らとの共同研究により、ナノポアシークエンサーで肺がんに存在する異常なmRNAの網羅的な同定をして、異常なmRNAから生じるペプチドが免疫細胞に認識されることを示しました。本研究成果は、2021年1月4日(月)に英国科学雑誌「Genome Biology」のオンライン版に掲載され、東京大学よりプレスリリースされました。

東京大学:(https://www.k.u-tokyo.ac.jp/information/category/press/3880.html

Miho Oka, Liu Xu, Toshihiro Suzuki, Toshiaki Yoshikawa, Hiromi Sakamoto, Hayato Uemura, Akiyasu C. Yoshizawa, Yutaka Suzuki, Tetsuya Nakatsura, Yasushi Ishihama, Ayako Suzuki, Masahide Seki, Aberrant splicing isoforms detected by full-length transcriptome sequencing as transcripts of potential neoantigens in non-small cell lung cancer. Genome Biology.  DOI: 10.1186/s13059-020-02240-8