「先進ゲノム支援」情報解析講習会のご案内
「先進ゲノム支援」(先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム)は、文部科学省科学研究費助成事業の新学術領域研究『学術研究支援基盤形成』 において、最先端のゲノム解析及び情報解析技術を提供して我が国のゲノム科学ひいては生命科学のピーク作りとすそ野拡大を進めることを目指し、2016年4月から支援活動を開始しています。
「先進ゲノム支援」では支援活動の一環として情報解析講習会を開催しています。今年度は、Linuxの基礎からDDBJスパコンの使い方、さらにはRNA-seq解析、バクテリアゲノム解析などの実践例題を中心に、以下の要領で情報解析講習会を開催いたします。
<2017年度「先進ゲノム支援」情報解析講習会>
- ■日 時:
- 2018年3月22日(木)13:00~3月23日(金)15:00
- ■会 場:
- 国立遺伝学研究所(DDBJ)静岡県三島市谷田1111
- ■想定スキルレベル:
- UNIX初心者
- ■募集人員:
- 若手研究者20名程度
- 応募者多数の場合は、先進ゲノム支援における支援依頼者を優先します。
さらに多数の場合は抽選等で参加者を決定いたします。 - 応募は支援依頼者毎、研究室毎に1名に限定させていただきます。
- 各自のPCを持参ください(Windows、Macいずれも可)
- DDBJスパコンのログインユーザアカウントが必要となります。お持ちでない方は事前に申請が必要となります。
- 応募者多数の場合は、先進ゲノム支援における支援依頼者を優先します。
- ■参加費用:
- 無料
■講習会スケジュール(予定):
【3月22日:1日目】
- 13:00~13:10
- 講習会説明
- 13:10~13:40
- DDBJスパコン概要説明
- 13:40~14:40
- UNIX基本コマンド
- 14:40~14:50
- 休 憩
- 14:50~15:50
- シェルスクリプト
- 15:50~16:50
- DDBJへの接続方法、バッチジョブ
- 16:50~17:00
- 休 憩
- 17:00~18:00
- DDBJスパコンでの解析の実践I(DDBJパイプライン)
【3月23日:2日目】
- 10:00~12:00
- DDBJスパコンでの解析の実践II(RNA-seq解析等)
- 13:00〜15:00
- DDBJスパコンでの解析の実践III(バクテリアゲノム解析)
尚、旅費、宿泊費は参加者でご負担下さい。
- ■申し込み〆切:
- 2018年2月22日(木)
- ■申し込み方法:
-
事前アンケート(word版/PDF版)をダウンロードし、ご記入下さい。
メール本文に以下の①~④の情報をご記載の上、アンケート用紙を添えて、事務局(genome-sec@nig.ac.jp)までメールにてお申込み下さい。
なお、メールの件名は「2017年度情報解析講習会申し込み」として頂くようお願い致します。
①氏名
②所属
③メールアドレス
④先進ゲノム支援依頼者の場合は代表者名
先進ゲノム支援事務局